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精确预测蛋白质相互作用

http://sports.sina.com.cn 2007年03月12日13:58  解放日报

  本报讯 (记者 徐瑞哲)记者前天从中科院上海药物所获悉,该所蒋华良研究员等发明出一套预测蛋白质—蛋白质相互作用的新方法,预测精确性大于80%。这项计算生物学重要成果发表于国际著名期刊《美国科学院院刊》(PNAS)本月在线版上。

  蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)决定着几乎所有的生物功能。目前,大多数蛋白质相互作用预测法都依赖于大量同源蛋白信息或蛋白相互作用标识物信息,应用范围有限;而新方法可仅依据蛋白质的序列信息,研究任意新蛋白的功能,或预测老蛋白的新功能,并可用于新药设计,对基因组研究也具有十分重要的意义。研究人员经过两年努力,用超过1.6万对实验测定了蛋白质相互作用结果,构建出通用性PPI预测模型。

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