荷兰三剑客中，范·巴斯滕的执教生涯是起步最晚的。与另外两位巨星的激进不同，巴斯滕的执教道路非常平稳，也许这和他个人的儒雅性格有关。他在2002年婉言谢绝了克鲁伊夫的邀请，没有加入荷兰国家队的教练组，去年7月再次拒绝出任巴塞罗那主教练的职位。只是在前不久，他还因为训练阿贾克斯前锋收效显著而得到了AC米兰的青睐，这次范·巴斯滕仍然没有动心，他目前惟一的愿望就是在7月进入阿贾克斯的一线队教练组，做科曼的“见习”。或许他的冷静和扎实，可以给荷兰创造一个真正的世界级教练。

　　退役后的巴斯滕一度专心于他喜爱的高尔夫球运动并大获成功，曾带领阿姆斯特丹队勇夺荷兰高尔夫甲级联赛冠军才。而他也并未完全离开心爱的足球运动，巴斯滕不时出现在某些纪念比赛中并仍有精彩绝伦的进球送给他的球迷。

　　2002年8月，巴斯滕参加了荷兰足球教练员培训班并开始在阿贾克斯青年队和一队实习，在这期间中锋米多和伊布拉西莫维奇还分别得到了巴斯滕的单独训练。2003年5月9日，巴斯滕拿到了荷兰职业教练员上岗证书，他决定和昔日的队友古力特、科曼、里杰卡尔德一样走向执教的道路。

　　结束了在荷兰足协的培训后，巴斯滕正式担任了阿贾克斯预备队的教练。上任前巴斯滕坦言：“尽管作为球员我获得了巨大的成功，但以教练员的身份出现在赛场上却是全新的开始，我将会满怀信心地迎接挑战。”在这里，他和昔日在阿贾克斯与荷兰国家队的队友范斯奇普配合，为阿贾克斯贡献了斯内德、德琼、海庭加等后起之秀。其中斯内德更可称为是2003年荷兰最耀眼的一颗新星。

　　巴斯滕虽然是阿贾克斯历史上最伟大的球员之一，但在训练中他从不把自己当成巨星，总是和所有年轻队员一视同仁，2002年冬天，巴斯滕在实习期间协助一队主教练科曼训练，科曼要求所有队员脱去帽子，巴斯滕也将自己的毛线帽扔在地上。科曼说：“马可，你不必脱帽。”但巴斯滕回答：“我和队员一样。”低调务实的巴斯滕目前仍在青年队教练的岗位上默默耕耘荷兰球迷和媒体都把他看成未来荷兰国家队主教练的希望之所在。